JSNP

From Variome

일본의 JSNP에서 공개한 자료는,

1) data
- Illumina 550K BeadChip samples : 934 Japanese
- 35개의 질환군별 Case 자료 : 200K snps, 191 ~ 195 samples/case

2) publication
- Bulk download 가능

 KOBIC의 응용 가능성은,
1) Illumina 550K는 정확한 geographic coordination이 없으므로, HapMap 자료보다 약함.
2) 35개의 질환군별 case 자료: 각 질환군별 200K 자료만 있는것으로 보아서는 Raw data인지, 1차 p-value 필터링을 한 데이터인지 파악 불가능. 논문을 찾아 확인 필요.


>> List of large-scale genotype and phenotype association study projects