서열 정렬(Sequence Alignment)

서열 정렬(Sequence Alignment)은 두 개 이상의 생물학적 서열(예: DNA, RNA, 단백질)들 사이의 유사성을 비교하고 가장 적절한 상동 관계를 찾아내는 계산적인 방법론이다.

핵심 개념

• 목표: 서열 간의 진화적 관계나 기능적 유사성을 파악하는 것이다.
• 방법: 서열들을 일직선상에 배치하며, 서로 다른 위치에 있는 염기나 아미노산 사이에 갭(gap)을 삽입하여 정렬한다.

정렬 과정에서는 점수 체계(Scoring System)를 사용하여 매칭(match), 미스매치(mismatch), 그리고 갭 페널티(Gap Penalty)를 부여하며, 이를 통해 최적의 정렬을 도출한다. 대표적인 알고리즘으로는 Needleman-Wunsch (전역 정렬)와 Smith-Waterman (지역 정렬) 등이 있다. 이러한 분석은 생물정보학 연구의 기초가 된다.