Alignment Gap

Alignment Gap은 주로 유전체학 및 생물정보학에서 두 개 이상의 서열(sequence)을 비교할 때 발생하는 불일치 영역을 의미합니다.

핵심 개념

• 서열 정렬 과정에서 두 서열 사이에 존재하는 삽입(insertion) 또는 결실(deletion)을 모델링하는 데 사용됩니다.
• 이러한 갭은 진화적 변화, 즉 돌연변이나 재배열의 흔적으로 해석될 수 있으며, 최소 거리 추정에 중요한 역할을 합니다.

Gap의 길이를 결정하는 것은 점수 행렬(scoring matrix)과 갭 페널티(gap penalty)의 설정에 따라 달라집니다. 적절한 갭 처리는 다중 서열 정렬의 정확도를 높이는 데 필수적이며, 이는 유전자 발현 연구의 기초가 됩니다.